1955年，北京铁路二中成立——由北京铁路分局筹建的铁路职工子弟学校；1978年被评为国家铁路系统重点中学；2004年，它被改名为西城区政府“北京铁路第二中学”。根据西城区扩大优质教育资源的总体部署， 2005年与原42中合并，当年被评为“北京示范性普通高中”，2007年与原铁三中合并。小学系成立于2020年，幼儿系成立于2021年。成为覆盖学前、小学、初中、高中的西城区十二年一贯制的完整中学。
1964年，毛泽东主席对学校第一任校长魏莲一的来信作了指示：学校的所有工作都应该有利于培养学生“在德、智、体等方面生动活泼地发展”。主席的指示成为学校贯彻党的教育方针，全面推进素质教育的思想指导。多年来，学校不断深化教育改革，落实立德育人的根本任务“和谐发展以人为本”办学理念明确“创办卓有成效的精品名校”提出了办学目标“真诚友好，科学素养，国际视野，国家栋梁”教育目标。
学校目前有两个校区，北校区位于北京市西城区月坛西街5号，南校区位于北京市西城区三里河东路9号。校园占地42716平方米，建筑面积57327平方米。小学和幼儿园位于北校区，拥有相对独立的校园（公园）区。
在深化教育教学改革的过程中，学校拥有团结务实的领导班子和高素质的教师队伍，不断构建科学的课程体系，坚持“五育并举”，培养学生的核心素养。加强学生的道德行为、心理健康、行为习惯、法律法规教育；注重科技教育，培养学生的创新思维和实践能力；发挥传统女排学校的优势，培养学生的健康身体；学校具有先进的学校理念、现代教学设施、优秀的教师团队、丰富的校园文化、科学的管理体系、教育教学质量、社会声誉。
学校先后荣获北京市示范高中、北京市党建示范点、北京市中小学科技教育示范学校、北京市排球传统学校、北京市文明礼仪示范学校、北京市交通安全先进单位、西城区素质教育优秀学校、西城区示范高中联合体成员学校、西城区初中建设工程先进学校、西城区科研先进单位、西城区心理教育示范学校、西城区安全校园等称号。
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