南京市第二十九中学成立于1945年，是江苏省第一批四星级高中，是国家级示范高中。2015年，学校被授予“全国文明单位”称号。中国科学院院士王怀民、加拿大工程院士刘江川、奥运冠军惠若琪是学校的杰出校友。
75年办学积淀，凝练成“厚德自强，纯正卓越”引领师生成长的办学理念。“厚德”、“自强”《周易》均来自《周易》：“天行健，君子以自强不息。地势坤，君子以厚德载物”。“厚德”意为“德厚” “感恩” “施以厚泽”。“自强”是指刚毅坚卓，自立自强，发怒图强。应以教育为基础“厚德自强”而树人。“纯正”，二十九中成立之初“每日十一问”中的内容。它指的是天性的纯洁和正直，意味着要保持生命的本真，保持纯洁的童心，这是创造力的源泉。“卓越”指的是“卓然独立，越胜己。”这就是教育的生命力。
“厚德自强，纯正卓越”办学理念是学校的核心价值，引领着学校的一切发展。在此基础上，形成了学校“追求卓越，永争第一”价值追求。“永争第一”是指生命的成长，是让生命有一种向上的动力，让生命有一种积极的精神，而不是狭义的理解“第一名”。因此，学校提倡“永争第一”，就是让每个学生在学会面对客观竞争的基础上，为生活注入目标、方向和动力。
学校始终坚持以质量为中心。自恢复高考以来，特别是自2015年以来，学校一直走在高质量办学的道路上。学校教育质量的整体发展水平处于南京高中第一方阵和江苏省高中的前列。从尖子生培养的角度来看，学校拔尖创新人才培养项目取得了丰硕成果。2016-2020年，学校高考400分以上的尖子生总数为113人，在南京排名第二。从整体水平来看，本一达线率逐年上升。从2017年80.1%到2018年91.3%、2019年的94.71%，再到2020年的96.13%。从顶尖大学的突破来看，北京大学和清华大学连续三年被录取5人。2018年，学校包括南京文科第一、第二名，文科第一名录取北京大学；2019年，学校再次包括南京文科第一、第二名，两名学生均被北京大学录取；2020年，学校理科三名学生达到清华大学录取分数线，其中两名被清华大学录取，理科最高分被复旦大学强基计划录取。在2020年的强基计划录取中，清华大学、复旦大学、南开大学分别录取了3名学生，在江苏省排名第19位。
学校一直致力于培养创新拔尖人才，学校坚持“走出去”与“请进来”双向联通、学生研究、院士讲座、开放互动；教学与教育合作，追求生命价值，培养民族感情，从学习态度到学习能力，学生成长伴随着整个过程、个性化的培训计划；科学与人文，经典阅读的渗透和综合实践课程的引入，拓宽了学生学习的新视野；教学与教学研究的结合是课堂和学校。29中学生的知识素养和实践能力在丰富的探索中蓬勃发展。
南京二十九中教育不仅面向全体，而且注重学生专业知识的培养。学校形成了相对完整的奥林匹克培训体系和科技课程体系。以机器人竞赛为例，学校发展水平已达到全国领先水平，全省一流，全市最好。连续三年获得全国乃至世界各类机器人赛事冠军，2019年、2020年获得世界机器人大赛最高全能奖、优秀组织奖。
近年来，学校还获得了教育部网络学习空间应用推广优秀活动学校、国家体育传统项目学校、江苏教学研究先进学校、江苏智慧校园示范学校、江苏德育先进学校、江苏国防教育示范学校、江苏社会科学推广示范基地、江苏儒家经典课程基地、南京大学创新人才培训战略合作伙伴等100多项荣誉。
十年树木，百年树人。南京二十九中教育在“厚德自强，纯正卓越”办学理念和“永争第一”在价值追求的引导下，不断推进学校使命、教育目标、学校精神、管理价值、课程建设、课堂教学、教师发展、学生发展等八个蓝图的发展；“奋斗、创造、追梦”以校园文化为主题；实现学生优秀成长，教师教学优秀，学校优质发展；努力为国家未来建设支柱，精英人才；从而更好地实现党和国家的要求“立德树人”的目标!
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